Chiyo Sakura é uma alegre garota do colegial que se apaixonou pelo esquecido Umetarou Nozaki. Para grande confusão de Chiyo, quando ela confessa a seu amado Nozaki, ele lhe entrega um autógrafo desconhecido. Como se vê, o adolescente estóico é na verdade um respeitado shoujo mangaka, publicando sob o pseudônimo Sakiko Yumeno! Uma série de mal-entendidos leva Chiyo a se tornar um dos assistentes de mangá de Nozaki. Durante os hilariantes eventos que se seguiram, ela faz amizade com muitos de seus colegas de escola peculiares, incluindo seu aparentemente assistente vergonhoso, Mikoto Mikoshiba, e o Príncipe da Escola, Yuu Kashima. Gekkan Shoujo Nozaki-kun segue Chiyo enquanto ela se esforça para ajudar Nozaki com seu mangá e espera que ele acabe percebendo seus sentimentos.