Macacos supersônicos, vampiros, homens-peixes falantes e todos os tipos de diferentes monstros sobrenaturais vivendo ao lado de humanos - isso tem feito parte da vida diária em Hellsalem's Lot, anteriormente conhecido como New York City, há algum tempo. Quando um portal entre a Terra e o Além foi aberto três anos atrás, os nova-iorquinos e as criaturas de outras dimensões foram presos em uma bolha impenetrável e foram forçados a viver juntos. Libra é uma organização secreta composta por excêntricos e super-humanos, encarregados de manter a ordem na cidade e garantir que o caos não se espalhe para o resto do mundo. Perseguindo a fotografia como hobby, Leonardo Watch vive uma vida normal com os pais e a irmã. Mas quando ele obtém os Olhos que Tudo Vêem dos Deuses às custas da visão de sua irmã, ele vai para Hellsalem's Lot a fim de ajudá-la encontrando respostas sobre os poderes misteriosos que recebeu. Ele logo se depara com Libra, e quando Leo inesperadamente se junta a eles, ele consegue mais do que esperava. Kekkai Sensen segue as desventuras de Leo no lugar mais estranho da Terra com seus camaradas igualmente estranhos - enquanto o menino comum vê inconscientemente sua vida dar uma guinada para o extraordinário.